Ronin, nová hrozba ve světě Ninjago, ukradne ninjům vzpomínky pomocí prstaré zbran nazvané Obsidian Glaive. Protože se ninjové nyní nedokáží rozvzpomenout, jak používat své základní schopnosti, musíš jim pomoci nalézt jejich obsidiánové zbraně, obnovit vzpomínky a obnovit jejich schopnosti, než se Roninovi podaří dokončit jeho záměry.
Ve hře Shadow of Ronin navštívíte místa známá z televizního seriálu.